Las temporadas recomendadas para la Ruta Ciclista del Danubio Passau-Vienna son:
Los mejores momentos para la ruta ciclista del Danubio son en primavera, mayo y junio, y en otoño, septiembre y octubre. En pleno verano, en julio y agosto, a veces puede hacer demasiado calor para andar en bicicleta durante el día. Pero si tienes niños que están de vacaciones en verano, estarás en la ruta ciclista del Danubio durante este tiempo y aprovecharás los momentos ligeramente más frescos del día, como la mañana y la tarde, para seguir pedaleando. Una ventaja de las temperaturas de verano es que puedes tomar un baño fresco en el Danubio. También hay hermosos lugares en Wachau en Spitz an der Donau, en Weißenkirchen in der Wachau y en Rossatzbach. Si viaja con una tienda de campaña a lo largo de la ruta ciclista del Danubio, también disfrutará de las temperaturas del verano. En pleno verano, sin embargo, es recomendable subirse a la bicicleta muy temprano en la mañana y pasar los días más calurosos a la sombra del Danubio. Siempre hay una brisa fresca cerca del agua. Por la tarde, cuando refresca, puedes hacer algunos kilómetros más.
En abril el clima es todavía un poco inestable. Por otro lado, puede ser muy agradable pasear por la ruta ciclista del Danubio en Wachau durante la época en que florecen los albaricoques. A fines de agosto, a principios de septiembre, siempre hay un cambio en el clima, como resultado de lo cual el flujo de ciclistas en la ruta ciclista del Danubio disminuye significativamente, aunque el clima ideal para ciclistas prevalece desde la segunda semana de septiembre hasta mediados de Octubre. Es particularmente agradable estar en la ruta ciclista del Danubio en Wachau durante este tiempo, ya que la cosecha de uva comienza a fines de septiembre y puedes ver a los viticultores cosechar las uvas. A menudo también existe la oportunidad de probar el vino que comienza a fermentar, que se llama "Sturm" en Baja Austria, al pasar por la granja de un viticultor.